Андрес Бонифасио родился 30 ноября 1863 года в манильском районе Тондо. Его отец Сантьяго был портным и управляющим речным паромом, принимавшем участие в местной политике. Мать, Каталина де Кастро была рабочей на сигаретной фабрике. Родители выбивались из сил, чтобы вырастить Андреса и еще пятеро детей, но в 1881 году Каталина заболела туберкулезом и умерла. Уже в следующем году заболел и скончался Сантьяго.
Так, в возрасте 19 лет Андресу Бонифасио пришлось отказаться от планов получить высшее образование и искать работу, чтобы поддержать своих осиротевших младших братьев и сестер.
В 1892 году он присоединился к Филиппинской лиге, основанной Хосе Рисалем и призывавшей к реформам испанское колониальное правительство. Организация успела провести лишь одну встречу до того как Рисаль был арестован и отправлен в ссылку на южный остров Дапитан.
Бонифасио и другие члены Филиппинской лиги не прекратили своей деятельности, и вскоре была образована группа под названием Катипунан или же Kataastaasang Kagalannalangang Katipunan ng mga Anak ng Bayan (буквально "Высшее и Глубокоуважаемое Общество Детей Отчизны"). Катипунан подразумевала уже военное сопротивление колониальному правительству. Ища опору среди низшего и среднего классов, Катипунан вскоре разрослась региональными группами во множестве филиппинских провинций.
В 1895 году Андрес Бонифасио стал основным лидером или Верховным Президентом Катипунан. Вместе со своими друзьями Эмилио Ясинто и Пио Велансуэлой, он начал издавать газету, называвшуюся Kalayaan, то есть "Свобода". Уже к 1896-му под руководством Бонифасио Катипунан выросла с 300 членов до 30000. 28 августа Андрес выпустил манифест, призывающий "все города подняться в одновременном восстании и атаковать Манилу", отправив вместе с текстами генералов, готовых повести наступление.
Поскольку испанцы сосредоточили все свои силы на обороне столицы, повстанческие группы в других областях постепенно начали брать верх. Наиболее успешной из таких групп была организация в провинции Кавите, возглавляемая Эмилио Агинальдо, представителем высшего сословия.
Тем временем пока Бонифасио не очень преуспевал в своей военной кампании, Агинальдо как успешный военный лидер, представитель влиятельной семьи и богатый человек ощутил возможность формирования собственного революционного правительства в противовес существующему правительству Бонифасио. В марте 1897 года благодаря фальсификациям он одержал победу на выборах революционного правительства.
К стыду Бонифасио, он не только уступил президентский пост, но и вовсе получил скромную должность министра внутренних дел. Когда Даниэль Тирона усомнился в его способности занять и этот пост (учитывая отсутствие университетского образования) оскорбленный Бонифасио выхватил пистолет и застрелил бы Тирону, если бы ему не помешал, присутствовавший при этом генерал Артемио Рикарте и Гарсия.
После выборов, Бонифасио отказался признавать новое революционное правительство. В ответ на что, Агинальдо выслал отряд для ареста Андреса. Несогласные не успели понять истинного умысла и позволили доставить Бонифасио в лагерь Агинальдо. При аресте был застрелен один из братьев Андреса - Чириако, сильно избит другой брат Прокопио, по некоторым сведениям изнасилована его молодая жена Грегория.
Агинальдо обвинил Андреса и Прокопио в измене и мятеже и после однодневного фальшивого суда, в ходе которого адвокаты скорее доказывали вину, нежели защищали осужденных, оба брата были приговорены к смерти.
10 мая 1897 года Прокопио и Андрес Бонифасио были расстреляны у горы Нагпатонг. Некоторые источники сообщают, что Андрес был слишком слаб, чтобы стоять на ногах из-за полученных недавно ран и был просто зарублен на носилках. По другим сведениям он пытался сбежать после смерти Прокопио, но все равно был застрелен.
Как первый предводитель революции и первый самопровозглашенный президент независимых Филиппин, Бонифасио является ключевой фигурой национальной истории. Однако, его роль и наследие по-прежнему остаются предметом для споров среди ученых и филиппинцев.
"Национальным героем" принято именовать Хосе Рисаля, хотя тот и выступал за мирный, реформаторский подход к преобразованию колониальной страны. Первым президентом Филиппин чаще всего называют Агинальдо, хотя Бонифасио принял этот титул еще до него. Так, можно констатировать, что с памятью об Андресе Бонифасио как и с ним самим произошла короткая расправа.
Подробнее см.:
Материалы, связанный с судом над Бониафсио (англ.) и
Краткая биография (англ.)